1.不孕：云南玛莉亚医院专家指出约有50%左右伴有不孕，在不明原因不孕中，约30%-40%患有子宫内膜异位，常因病变造成盆腔肿块等因素引起。
2.痛经：临床特征为渐进性痛经，多为继发性，有的痛经较重难忍，需要卧床休息或用药止痛，疼痛常随着月经周期而加重，月经结束而消失。
3.周期性直肠刺激症状：直肠、肛门、外阴部坠胀、坠痛、里急后重感和大便次数增多。
4.月经不调：常有月经周期缩短、经量增多或经期延长等现象，说明有卵巢功能障碍表现。
5.性交痛：当存在于阴道穹窿部异位子宫内膜结节、直肠凹陷结节或粘连，或卵巢粘连在盆底时，均可产生性交痛。
6.周期性膀胱刺激症状：当病变累及膀胱腹膜反褶或侵犯膀胱肌层时，会同时出现经期尿急、尿频等症状。若病变侵犯膀胱黏膜则有周期性血尿和疼痛。
7.经期或行经前后的急腹症：云南玛莉亚医院专家指出一般为卵巢子宫内膜囊肿，有穿破的特点，多数因卵巢囊肿扭转或宫外孕而急诊手术。
