卵巢囊肿患者通过服用药物治疗能否好需要根据具体情况判断。如果是生理性黄体囊肿，一般可以自愈而消失；炎症性囊肿、巧克力囊肿等良性囊肿经过积极的抗炎治疗后通常也可以达到临床的目的，但部分恶性肿瘤导致的囊肿则不能够被治好。
一、可能会好的情况
1.生理性黄体囊肿：如果患者的卵巢囊肿是由于怀孕早期引起的生理性黄体囊肿，在妊娠结束后囊肿会自然缩小或消失，无需进行特殊处理。
2.炎症性囊肿：若卵巢囊肿是由输卵管炎引起，并且没有发生严重粘连，则可以在医生指导下使用头孢类抗生素联合甲硝唑片进行抗感染治疗，待炎症消退以后囊肿也会随之消失。但如果已经造成严重粘连，则需在腹腔镜下将囊肿切除。
3.巧克力囊肿：即子宫内膜异位囊肿，主要是因为异位子宫内膜周期性出血形成，患者可遵医嘱应用孕激素和雌激素药物抑制月经来潮，以减少经期出现疼痛的情况。但如果囊肿体积较大并伴有明显不适症状时，则建议行手术将其切除。
4.其他良性囊肿：对于直径＜5cm的良性囊肿，如果没有明显的不适症状也可先给予观察，定期复查即可。而对于直径＞5cm者则可在腹腔镜下进行剔除术，从而保留正常的卵巢组织。
二、可能不会好的情况
卵巢恶性肿瘤会导致卵巢上产生囊肿样改变，常会引起腹部包块及腹胀等症状，还会对周围组织造成浸润及压迫，因此恶性的卵巢囊肿通常无法被完全治好。虽然恶性程度较高的上皮性癌五年生存率只有百分之二十到五十，但是仍可以通过综合性治疗使患者获得较好的生活质量，如手术治疗、放疗、化疗以及生物靶向治疗等。
卵巢囊肿患者应保持良好心态，积极配合医生用药或者手术治疗。日常生活中还应注意个人卫生，勤换洗贴身衣物，避免加重病情。
