临床上治疗尖锐湿疣的药膏有很多，但大多都属于腐蚀性药物。常用有三氯醋酸、足叶草脂酊等，涂抹在局部可以起到杀死病毒的作用。另外还可以使用咪喹莫特乳膏、鬼臼毒素软膏等外用药物进行治疗。
一、三氯醋酸、足叶草脂酊
1.三氯醋酸：由三氯醋酸和乙醇配制而成，涂抹于患处后可缓慢挥发，因其具有较强的腐蚀性，故只适用于皮肤表面表浅的损害。若出现腐蚀面积过大或深度过深的情况，则需要配合物理方法去除。
2.足叶草酯酊：是一种无色透明液体，主要成分是足叶草脂，在接触空气中的氧气时可分解成高效的酚类物质，从而发挥抑制病毒生长繁殖的作用。一般用于治疗HPV感染引起的寻常疣、扁平疣以及跖疣等疾病，对早期的尖锐湿疣也有较好的疗效。
二、咪喹莫特乳膏
该药为局部免疫调节剂及表皮细胞活性剂，可用于治疗成人浅表型单纯性斑疹伤寒、不典型增生和原位癌，也可用于治疗尖锐湿疣，用药期间应遵医嘱定期复查。
三、鬼臼毒素软膏
其作用机制是干扰生物酶系统，阻碍细胞膜的合成而致细胞死亡，对尖锐湿疣产生的效果相对较好，但是孕妇要慎用此药。
四、其他
如氟尿嘧啶软膏、5-氟胞嘧啶软膏等抗代谢药物，也可以通过破坏DNA结构来达到治疗的目的。但由于其副作用较多，所以需严格掌握适应证，并在医生指导下应用。
此外，患者平时也要注意个人卫生，勤换洗内裤，避免不洁性生活。如果病情较严重，还需及时到医院就诊并积极配合医生治疗。
