临床上常使用咪喹莫特乳膏、鬼臼毒素软膏等外用药物进行治疗，也可以通过注射药物或口服药物的方式进行治疗。另外患者还可以选择冷冻疗法、激光治疗以及微波治疗等方式进行辅助治疗。
一、外用药物
1.咪喹莫特乳膏：主要成分为咪喹莫特，具有免疫调节和细胞毒性作用，可使疣体组织崩溃、坏死、脱落，适用于不伴有皮损增殖的寻常疣、扁平疣及尖锐湿疣患者的局部治疗。
2.鬼臼毒素软膏：是一种从毒蕈真菌提取的鬼臼树脂衍生物，其成分经涂抹于患处后，可在细胞水平产生多种作用而终导致尖锐湿疣损害体积缩小甚至消失。但需注意孕妇忌用此药，哺乳期妇女也应慎用，儿童应在医生指导下使用。
二、注射药物
常用醋酸曲安奈德注射液，属于肾上腺皮质激素类药物，可用于治疗尖锐湿疣所引起的皮肤症状，如瘙痒、疼痛等症状。但由于该药物具有一定刺激性，因此一般不建议注射在疣体周围，以免影响病情恢复。
三、口服药物
常见有转移因子胶囊、胸腺肽肠溶片等，对于无法采用物理方法去除的人群，可以在医生指导下服用此类药物以提高机体免疫力，从而发挥抗病毒作用，促使尖锐湿疣消退。
四、其他方式
1.冷冻疗法：是利用制冷剂快速产生低温液体，使其作用在尖锐湿疣部位，从而达到破坏病变组织的目的，可以有效清除表面较大的尖锐湿疣病灶，但是容易出现出血、瘢痕形成等情况。
2.激光治疗：是利用高能量激光照射在尖锐湿疣部位，能够瞬间爆发巨大能量，对尖锐湿疣进行灼烧，从而将其去除，但可能会出现色素沉着的情况。
3.微波治疗：是将高频大功率电磁波应用于尖锐湿疣治疗的一种方法，可通过微波产生的热量对尖锐湿疣进行烧灼，从而将其去除，但术后易复发。
以上只列举了部分常见的治疗方法，患者发现疾病后应及时到医院就诊，在专业医生指导下根据具体情况进行针对性治疗，切不可盲目用药。
