临床上对于尖锐湿疣的治疗方法较多，常见的包括药物治疗、物理治疗、手术治疗等。由于尖锐湿疣具有传染性，并且容易复发，因此在进行积极治疗的同时，还需要注意加强护理。
一、药物治疗：1.咪喹莫特乳膏：属于局部外用免疫调节剂，能够诱导细胞分化与增生，从而起到治疗尖锐湿疣的作用。但需要长期用药才能起效，在使用时应注意观察局部反应，如果出现红斑、烧灼感等症状，则应停止用药。此外，孕妇及哺乳期妇女应在医生指导下谨慎使用此药。
2.鬼臼毒素酊：主要成分为鬼臼毒素，是一种抗有丝分裂的药物，可通过干扰细胞周期进程引起细胞死亡而发挥其疗效。该药对早期或面积较小的尖锐湿疣疗效较好，一般连续使用3-4周可见明显效果，不良反应较少见，偶有过敏反应和刺激症状如局部发红、烧灼感等。
3.三氯醋酸溶液：为消毒防腐剂，可使疣体坏死并逐渐脱落。但由于腐蚀作用较强，故需由专业医务人员配制后给患者局部应用，以减少损伤。
4.其他药物：除上述常见药物以外，也可遵医嘱选择氟尿嘧啶软膏、二氯醋酸二异丙胺等药物，也具有一定疗效。
二、物理治疗：尖锐湿疣大多通过不洁性生活感染人乳头瘤病毒所致，常发生在外生殖器及肛门等部位。若皮损较大、增多迅速，应及时就医，可行激光、冷冻、电灼、微波等方法去除疣体。其中激光是利用高能量激光气化或炭化尖锐湿疣，使其失去活性而达到目的；液氮冷冻是利用低温液体产生超低温而使尖锐湿疣组织凝固、坏死而脱落，适用于疣体较大的情况；电灼则是利用高频电流产生的热效应直接破坏尖锐湿疣上皮，使之碳化变形，可用于清除表浅和小型尖锐湿疣；而微波则是利用其产热使尖锐湿疣内蛋白变性凝固而达到治疗目的。
三、手术治疗：若尖锐湿疣体积过大或者数量过多，无法通过以上方式处理，则可在医生建议下采取手术切除的方式进行治疗，即直接通过外科手术将病灶切除，通常预后良好。
四、其他治疗：部分尖锐湿疣还可采用光动力疗法、免疫疗法等方式治疗，均可取得一定疗效。
